La biodiversité
Suivi génétique des espèces animales par génotypage de marqueurs génétiques
ANTAGENE propose des marqueurs génétiques pour un suivi efficace des populations animales. Les données collectées constituent des informations essentielles pour les stratégies de gestion des espèces sauvages
Le suivi génétique des populations consiste à surveiller et analyser les caractéristiques génétiques des populations animales. Cette approche permet de comprendre la diversité génétique au sein des populations, ainsi que les changements qui peuvent se produire en réponse à divers facteurs environnementaux, biologiques ou anthropiques
Il joue un rôle crucial dans la conservation des espèces menacées en aidant à concevoir des stratégies adaptées pour la gestion efficace de la biodiversité
Le suivi de population utilise la technique de génotypage qui vise à déterminer le profil génétique d’un individu au moyen de marqueurs génétiques. Ces marqueurs génétiques sont propres à chaque espèce et doivent être développés spécifiquement. Deux types de marqueurs génétiques sont proposés par ANTAGENE :
Dans le cadre du suivi génétique des populations d’animaux sauvages, ces marqueurs permettent d’identifier les variations génétiques spécifiques, telles que des allèles ou des mutations, entre les individus et d’évaluer la diversité et la structuration génétique de ces populations
Pour le suivi génétique des populations, deux types d’échantillons peuvent être utilisés :
Si ces échantillons permettent d’avoir une très bonne qualité d’ADN pour les analyses génétiques, ils s’avèrent contraignants pour les animaux car ils nécessitent de capturer les animaux pour réaliser les prélèvements.
Ces échantillons ont l’avantage d’être moins contraignants pour les animaux car ils peuvent être retrouvés dans la nature. Cependant l’ADN présent est souvent dégradé et faible quantité (ADN trace), nécessitant des conditions de prélèvement et de conservation adaptées
Il faut analyser un nombre suffisant d’échantillons issu d’individus différents pour que les résultats soient suffisamment représentatifs de la population étudiée
Dans le but de documenter, surveiller et évaluer l'état des populations animales, ANTAGENE propose différentes applications au suivi génétique de population :
L’identification individuelle est l’empreinte génétique, ou profil génétique, d’un individu. Elle est obtenue par l’analyse de marqueurs moléculaires de l’ADN. Cette empreinte génétique est propre à chaque individu et permet de déterminer et d’identifier un animal tout en nous renseignant sur ses caractéristiques génétiques
Le sexage génétique est la détermination génétique du sexe d’un animal. Le sexage ADN consiste à rechercher dans un échantillon d’un animal la présence des chromosomes sexuels spécifique du mâle ou de la femelle. Cet outil peut aussi bien être utilisé pour les espèces captives pour lesquelles le déterminisme sexuel est impossible ou bien pour les espèces sauvages pour connaitre le sex-ratio d’une population sur un territoire
L’hybridation est le croisement entre deux individus de sous-espèces ou d’espèces différentes, on parle alors d’hybridation intraspécifique ou interspécifique. Bien que l’hybridation soit naturelle et peut être bénéfique pour les espèces et la biodiversité, ce phénomène peut constituer un danger pour certaines espèces menacées ou protégées, notamment quand des espèces sont obligées de cohabiter pour survivre. L’hybridation entre des espèces exotiques envahissantes (EEE) et des espèces indigènes peut notamment constituer un risque en entrainant la perte de traits génétiques uniques, réduire la diversité génétique et, dans certains cas, conduire à l'extinction des espèces locales
La diversité génétique est le degré de variabilité des gènes au sein d’une population animale qui nous renseigne sur son potentiel évolutif et sur sa viabilité. Elle est une composante essentielle de la conservation de la biodiversité en permettant notamment aux espèces de s'adapter à d'éventuels changements environnementaux. Le maintien dans une population de ressources génétiques suffisamment larges est primordial. La diversité génétique d’une population animale est évaluée en estimant l’hétérozygotie (fréquence d’individus hétérozygotes) et la richesse allélique
La structuration génétique informe sur la présence ou l’absence de flux de gènes entre différents groupes et permet de discriminer l’émergence de sous-populations. Une forte structuration à l’intérieur de chaque sous-population, témoigne de l’absence ou d’un faible flux génétique entre elles. Or ces flux jouent un rôle capital en assurant le mélange des gènes entre populations et en évitant le phénomène de dérive génétique
Le domaine vital est l’aire où un animal, ou un groupe d’individus, vit ordinairement et qui lui suffit à répondre à ses besoins primaires. Connaître cet espace et la façon dont il est utilisé est primordial pour la conservation des espèces. Dès lors, l’analyse génétique des traces de présence d’une espèce sur un territoire permet de faire un suivi des déplacements individuel précis et de connaître l’utilisation de ce territoire pour chaque individu
L’estimation des effectifs d’une population animale est parfois très compliquée du fait de la difficulté à observer certaines espèces. Or, l’identification génétique des individus à partir des indices de présence permet d’utiliser la méthode de capture-marquage-recapture (CMR) sans devoir capturer le moindre animal et permet ainsi d’estimer les effectifs d’une population
La parenté est un facteur clé de l’évolution génétique des populations. La reproduction entre individus fortement apparentés entraine des tares génétiques (accumulation d’allèles délétères, apparition de maladies ou malformations phénotypiques), l’estimation des liens de parentés entre chaque individu d’une même population permet d’avoir une idée de son état de santé. Les marqueurs moléculaires permettent ainsi de déterminer le coefficient de parenté entre deux individus, appelé aussi coefficient d’apparentement
La continuité écologique d’un territoire se détermine par sa capacité à favoriser les interactions entre ses différentes populations animales. L’évaluation des flux génétiques au sein des populations permet de voir si le territoire joue un rôle de continuité écologique ou bien s’il fait apparaître de l’isolement génétique. Elle permet de déterminer si la Trame Verte et Bleue (TVB) d’un territoire assure les connexions nécessaires entre les différents habitats naturels pour permettre aux espèces de se déplacer, de se reproduire, et ainsi maintenir leurs interactions génétiques, réduisant les risques de consanguinité et d’extinction
ANTAGENE a développé des marqueurs génétiques (microsatelittes ou SNP) sur un grand nombre d'espèce :
N'hésitez pas à nous contacter si vous souhaitez plus de renseignements sur l'une de ces espèces ou si vous envisagez de travailler sur d'autres espèces
