L’identification d’espèces Canidés est la détermination des principales espèces de canidés présentes où le territoire français ou européens (Chien, Loup, Renard, Chacal) à partir d’indices de présence récupérés en milieu naturel. Particulièrement utiles pour l’inventaire et le suivi d’espèces animales protégées, patrimoniales voire même envahissantes (Chien viverrin, Chien marron), les outils ADN proposés par ANTAGENE permettent de caractériser génétiquement une espèce à partir de n’importe quel type de prélèvement (poils, crotte, urine, ossement).

L’identification de lignée (ou approche phylogéographique) est une approche génétique qui vise à analyser les différents haplotypes de l’ADN mitochondrial d’une espèce dans l’objectif de déterminer l’origine géographique de cette espèce sur un territoire, ou d’évaluer l’isolement géographique entre deux populations. ANTAGENE est capable de déterminer ces haplotypes à partir d’un simple indice de présence (poil, crotte, tissu, urine, plume etc.).

L’identification individuelle est l’empreinte génétique, ou profil génétique, d’un individu. Elle est obtenue par l’analyse de marqueurs moléculaires de l’ADN. Cette empreinte génétique est propre à chaque individu et permet de déterminer et d’identifier un animal à partir de simples indices de présence (poil, crotte, tissu, urine, plume etc.) tout en nous renseignant sur ses caractéristiques génétiques. Ces informations s’avèrent essentielles pour le suivi et la gestion de populations animales. ANTAGENE propose des marqueurs génétiques pour un grand nombre d’espèces animales.

Le domaine vital est l’aire où un animal, ou un groupe d’individus, vit ordinairement et qui lui suffit à répondre à ses besoins primaires. Connaître cet espace et la façon dont il est utilisé est primordiale pour la conservation des espèces. Dès lors, l’analyse génétique des traces de présence d’une espèce sur un territoire permet de faire un suivi des déplacements individuel précis et de connaître l’utilisation de ce territoire pour chaque individu.

Le sexage génétique est la détermination génétique du sexe d’un animal. Le sexage ADN consiste à rechercher dans un échantillon d’un animal la présence des chromosomes sexuels spécifique du mâle ou de la femelle. Cet outil peut aussi bien être utilisé pour les espèces captives pour lesquelles le déterminisme sexuel est impossible ou bien pour les espèces sauvages pour connaitre le sex-ratio d’une population sur un territoire. ANTAGENE a développé des marqueurs sexuels sur un certain nombre d’espèce.

L’estimation des effectifs d’une population animale est parfois très compliquée du fait de la difficulté à observer certaines espèces. Or, l’indentification génétique des individus à partir des indices de présence permet d’utiliser la méthode de capture-marquage-recapture (CMR) sans devoir capturer le moindre animal et ainsi estimer les effectifs d’une population. ANTAGENE collabore à l’estimation d’effectif d’un grand nombre d’espèce.

La parenté est un facteur clé de l’évolution génétique des populations. La reproduction entre individus fortement apparentés entraine des tares génétiques (accumulation d’allèles délétères, apparition de maladies ou malformations phénotypiques), l’estimation des liens de parentés entre chaque individu d’une même population permet d’avoir une idée de son état de santé. Les marqueurs moléculaires permettent ainsi de déterminer le coefficient de parenté entre deux individus, appelé aussi coefficient de consanguinité. ANTAGENE est capable de déterminé les degrés de parenté pour de nombreuses espèces.

La continuité écologique d’un territoire se détermine par sa capacité à favoriser les interactions entre ses différentes populations animales. L’évaluation des flux génétiques au sein des populations permet de voir si le territoire joue un rôle de continuité écologique ou bien s’il fait apparaitre de l’isolement génétique.

La diversité génétique est le degré de variété des gènes au sein d’une population animale qui nous renseigne sur son potentiel évolutif et sur sa viabilité. Elle est une composante essentielle de la conservation de la biodiversité en permettant notamment aux espèces de s'adapter à d'éventuels changements environnementaux. Le maintien dans une population de ressources génétiques suffisamment larges est primordial. ANTAGENE permet d’évaluer la diversité génétique d’une population animale en estimant l’hétérozygotie (fréquence d’individus hétérozygotes) et la richesse allélique.

La structuration génétique informe sur la présence ou l’absence de flux de gènes entre différents groupes et permet de discriminer l’émergence de sous-populations. Une forte structuration à l’intérieur de chaque sous-population, témoigne de l’absence ou d’un faible flux génétique entre elles. Or ces flux jouent un rôle capital en assurant le mélange des gènes entre populations et en évitant le phénomène de dérive génétique.