La biodiversité
Identification génétique d’espèces par barcoding ou métabarcoding
ANTAGENE propose d’analyser l’ADN environnemental (ADNe), pour détecter et identifier les espèces présentes dans l’environnement et permettant de définir un inventaire de la biodiversité des écosystèmes
L’ADN environnemental ou ADNe est l’ensemble de l’ADN des organismes présents dans les différents compartiments environnementaux : eau, sol, air
L’ADNe constitue l’ensemble du matériel génétique que l’on retrouve dans l’environnement sous forme d’ADN libres extracellulaires, d’ADN intracellulaires contenu dans les cellules libérées par les organismes vivants (excréments, sécrétions, cellules mortes etc.) ainsi que dans les organismes uni et pluricellulaires (bactéries, champignons, diatomées, phyto et zooplanctons)
L’analyse de l’ADN environnemental utilise les techniques génétiques du barcoding ou du métabarcoding pour l'identification et la caractérisation des espèces. Ces techniques diffèrent par leur application et leur objectif ainsi que par le type d’échantillon à analyser :
Deux méthodes peuvent être utilisées :
Le Séquençage classique (Sanger) est une méthode de séquençage de l'ADN qui permet de déterminer l'ordre précis des bases nucléotidiques dans une région spécifique de l'ADN pour l'identification d’une espèce précise
La PCR quantitative (PCRq) est une méthode qui amplifie spécifiquement une région d'ADN cible permettant une détection ciblée d'une espèce
Pour l’analyse de l’ADN environnemental plusieurs types d’échantillons issus des différents compartiments environnementaux peuvent être utilisés :
L’analyse de l’ADN environnemental contribue à l’évaluation et la préservation de la biodiversité et des écosystèmes, en permettant de :
